A település már 1430-ban is egyházashely volt, középkori temploma a mostani helyén állt.

A mai templom az 1790-es években épült barokk stílusban, szentélye feltehetőleg a középkori templomból maradt meg. 1925-ben részben átépítették, így mára inkább eklektikus stílusú.

Oltárképe Keresztelő Szent Jánost ábrázolja, a festmény az 1950-es években készült. A magyargencsi templom egyik legszebb tárgya egy ezüstözött örökmécses a XIX. század második feléből, ami a szentélyben függ.